一、补贴的分配原则
1.卫生部根据合同的重要程度、水平、工作量、效益、计划执行情况，以及参加合同的科技人员全时人数，核定各合同补贴总额。
2.合同负责人在分配岗位补贴时，要根据个人承担任务多少、责任大小和实际贡献等，拉开档次，不搞平均主义，要切实保证补贴主要用于承担合同任务的骨干人员。
3.凡直接参加国家“七五”重点科技攻关项目的科技人员，在按计划进行研究期间，可以享受岗位补贴。但同时参加“863”高技术项目、自然科学基金会支持的重大前沿性基础研究项目或参加两个以上国家重点科技攻关项目的科技人员，不得重叠享受岗位补贴。
执行合同期间出国进修3个月以上，回国后继续承担合同任务者，可以继续享受岗位补贴，在国外期间补贴费停发。
承担攻关合同横向协作任务(包括二级合同)或临时性分析、测试、应用等任务的人员不得享受本补贴。
4.提前完成任务的合同，仍按合同原规定时间发给岗位补贴;凡确定调整下来的合同，即停止发放其岗位补贴。
5.补贴从1988年元月起试行。
6.补贴列入科研项目经费支报，并计入发放单位的工资总额。
7.补贴要专款专用，不得提取管理费，不得拖欠周转。
二、补贴的管理办法
1.卫生部科技司委托全国肿瘤防办、全国心血管病防办、全国脑血管病防办、北京医科大学科研处、预防医科院科技处、医科院医药生物技术研究所科研处，按照原分管的合同数分别进行管理，并在科技司的统一协调下，具体核定各个合同的全时科技人员数和补贴金额，办理拨款手续。
2.承担合同的单位，负责补贴的申报、领取和发放，在每年年终前，向卫生部科技司及其委托单位报告计划执行情况的同时，要填报科技人员岗位补贴当年决算表和下年计划表，承担合同单位的负责人，对合同负责人分配补助有监督和协调的权力，并确定合同负责人的补贴金额。
3.承担合同的负责人，有分配岗位补贴的自主权。
三、补贴的发放
卫生部科技司及其委托单位，根据承担合同的单位申报的“科技人员岗位补贴计划表”核定人数和金额，按年下拨经费;承担合同的负责人再分配给每1个科技人员;承担合同的单位可从核准的补贴总额中先拿出不超过70%的补贴费，按阶段发放，其余30%，到年终按合同进展情况核发，如未完成计划的可视情况予以减发或不发，其结余部分，允许转入下1年度继续使用。1988年的岗位补贴于春节前要发到科技人员手中。
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