一、在教学管理上，卫生部负责办学标准、专业设置、招生计划、学制、组织编写推荐教材和教学质量的评价。在科研管理上，卫生部负责根据国家计委、科委的要求制定医药卫生科研规划与总计划下的国家攻关项目、部攻关项目和部重点课题，并实行同行评议，择优支持。同时，管理发明、专利、自然科学奖以及部级科技成果奖。

二、扩大院校办学的自主权。在完成国家下达的指令性招生计划和保证不断提高培养人才质量的前提下，允许适当接受有关部门和用人单位的委托，培养本、专科生和研究生(按教育部、国家计委、财政部联合下发的《高等学校接受委托培养学生的试行办法》执行);可以办各种进修班;可以与委托单位联合采取多种形式办学(涉及学历和毕业生分配问题按国家有关规定办理)。

教学过程由学校自己掌握。学校可以根据自己的特点自行确定教学计划和课程设置，自编自选教材和教学大纲，自行制订考试制度和考试方法。

三、扩大科研单位的自主权。在积极完成国家、部级攻关项目和部重点课题的前提下，可以接受委托科研任务和参加联合开发，可以自行决定协作单位，自行组织鉴定(评审)、奖励成果。

四、扩大研究生管理自主权。已经有权招收研究生的单位，增列新的研究生招生学科、专业，由招生单位根据招生条件和实际情况审批，报卫生部备案，新增学科、专业的招生计划数字应在卫生部分配的招生计划数字内安排。已获硕士学位授予权的学科、专业开办研究生班，招生对象为在职人员，又能自行解决培养经费的，由学校审批确定，报卫生部列入计划，报教育部备案，研究生班的毕业生分配，由各办班单位负责。博士研究生申请博士论文答辩，由所在单位审批，报卫生部备案。

五、根据卫生部核定的编制和事业经费，按照精简和提高工作效率的原则，各单位可以决定本单位的部、系、处、附设性研究所(室)一级机构的设立、撤销(附属中等专业学校除外)和干部任免。可以自行聘请名誉教授(研究员)、客座教授(研究员)和批准国外聘请本单位的科学家担任各种学术职务。根据国家有关规定，可以按照限额审批副教授、主任医师、副主任医师以及相应技术职称。

六、各单位教育、科研经费的使用按(84)卫计字第226号文《关于进一步扩大直属单位财务、基建、物资自主权的暂行办法》执行;对外技术交流的审批权按(84)卫外字第369号文《关于简化部分外事手续的暂行办法》执行。

七、今后各直属单位凡根据卫生部下发的各项扩大自主权的办法以及当地有关改革的规定制订的改革方案，可不再报批，报部备案即可。